現代醫學各種机械干預疾病的措施和新藥物不斷湧現並應用於臨床，為許多疾病防治帶來了新的希望。但環顧現代醫學疾病譜的整個畫面，我們發現人類在疾病治療方面能夠做的還較為局限:不要說腫瘤、艾滋病(AIDS)、老年性痴獃、慢性阻塞性肺病、糖尿病等，即使普通病毒性感冒，西藥也是對症治療，對病理過程基本無阻斷作用。於是，在現代西醫診療之外，人們不得不從傳統經驗醫學和自然療法中尋求治療疾病、緩解病痛的方法，且日漸成為世界範圍的一個醫療趨勢。
隨着現代醫學的迅速發展，人們逐漸發現心腦血管疾病、自身免疫疾病、代謝性疾病等和單一病因的細菌感染疾病明顯不同，突出表現為如下幾個特點:(1)疾病本身是機體代謝、衰老過程 伴隨的病理生理變化；(2)多因素交互致病，社會、遺傳、精神、環境、生活習慣等綜合一起；(3) 病理生理變化複雜，代謝障礙、免疫調控失常、神經內分泌失調等相互並存，局部病理改變、體征和臨床癥狀往往是全身疾病在局部的反應；(4)單一靶點或單一因素的拮抗、逆轉、控制，難以獲得理想的效果。在生理狀態下，人體通過基因、蛋白質的網絡調控，各種複雜生命活動維持在一定的相對平衡狀態，諸如同化與異化、吸收與排泄、免疫反應中的抗原與抗體等；在病理狀態下，人體同樣進行着這種由不平衡向平衡的動態變化。若各種生理病理因素的動態變化趨於相對平衡和有序，則疾病向愈；反之，則疾病進展或惡化。如何進行針對性多因素、多靶點的干預，使機體恢復或維持在健康平衡狀態或者疾病平衡狀態，對於一個原因不清的複雜疾病，顯然只有多基因、蛋白質靶向的綜合干預才有望獲得理想的整體療效。
傳統中醫學經過幾千年的臨床觀察總結，積澱了許多行之有效的診療疾病方法，雖然目前不能闡釋清楚其治病的機理，但其認識和防治疾病的方法仍具有極為重要的醫療價值取向。
傳統中醫學將自然界的各種生態變化用相互矛盾的“陰”、“陽”概念去概括，用自然界“陰”、“陽”變化的規律指導人體生理、病理的觀察，認為機體的生理活動皆處在對立統一的“陰”、“陽” 矛盾變化之中，相互聯繫，維持着生命的動態平衡。
一旦“陰”、“陽”出現偏盛或偏衰，機體就會發生疾病。可見，傳統中醫學治療疾病的重點在於如何調整機體的動態平衡，而不是針對某一個病理環節逆轉或拮抗。
在長期臨床實踐經驗的基礎上，根據機體“陰”、“陽”變化的不同，將具有不同陰、陽屬性的中藥有機地結合一起組成中藥復方去調節機體陰、陽的偏盛、偏衰，回復機體陰陽的動態平衡。這種診療疾病的模式有如下特徵:(1)注重機體的整體功能；(2)注重疾病的動態變化；(3)將機體生理病理變化和自然界動植物的生物陰陽屬性納入一個整體系統中去認識、 分析問題。
這在傳統中藥的機理中就有很好的體現。中醫藥和中藥復方的成分十分複雜，一味中藥可含有幾十種或幾百種化學成分，一個由4至5味中藥組成的復方則可有上千種化學成分甚至更多， 因此，有理由認為中藥復方是天然組合化學庫。即使是單一中藥或單一中藥的某個有效成分群，其作用也比化學合成藥物複雜得多。正是這種複雜的作用，在中醫理論指導下的辨證施治方法產生了有利於機體整體恢復動態平衡的效果。近年來，在傳統中醫理論認識指導下，人們利用現代葯化分析和生物技術，探索中藥或中藥復方有效化學成分和治療藥物干預疾病的新靶點，獲得一定進展。
人們在自然藥物及其藥物群化學成分的分析和作用機制研究中，得到許多新的發現，但面對自然藥物眾多化學成分的有序組合(尤其是中藥復方)及與人體內環境錯綜複雜的作用聯繫，目前的研究還是初步的。機體內部複雜的生物聯繫變化，相對於人們的認識能力永遠是一個不能完全解釋清楚的黑箱；自然界藥物所含有的大量生物信息，對人體病理生理變化的影響永遠值得人們探索。
因此，無論現代醫學如何發展，都有必要將人體作為一個黑箱整體，利用現代科學技術探索人體適應自然界(包括食物、藥物和生態環境等)輸入、輸出生物信息變化的規律。幾千年傳統中醫藥防治疾病經驗，及其將自然界藥物和人體納入一個整體系統辨識藥物治療疾病生物效應的方法，對現代醫學研究人類多基因疾病複雜疾病發生髮展的奧秘，進而有效的防治干預具有十分重要的意義，值得深入系統研究，使其為人類的健康作出更大貢獻。
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