我們一直強調小兒腦癱的治療是一項綜合過程，早期以康復訓練為主，但是部分腦癱兒童由於忽視了早期治療，肌肉的攣縮、骨和關節的畸形不可避免地會產生。在這種情況下，物理治療往往難以奏效，外科手術成為不可缺少的治療手段。對於這類患兒，手術矯治是保證康復治療計劃有效實施的重要措施。
根據人年齡越小，腦和神經系統的可塑性越大的發育特點，所以小兒腦癱越早治療，效果越好。腦癱的治療應包括早期干預、康復訓練及手術治療。早期干預包括氧療、藥物治療和康復訓練(康復訓練對於腦癱患者應是長期的)。手術治療主要包括：解除痙攣的手術(如FSPR手術);各項關節矯形手術及改善平衡和協調能力的手術(如頸動脈外膜剝脫術)。
其中，占絕大多數比例的痙攣型腦癱患兒適用FSPR術，而非痙攣型腦癱患兒則要視具體情況而定：一般是以肌張力不穩定增高和肌肉不自主運動為主要表現，以平衡和協調功能障礙為主的混合型和徐動型腦癱相對多見，其主要病因是出生時中、重度窒息及病理性黃疸引起，此種類型的腦癱可進行頸動脈外膜剝脫手術，以改善平衡和協調能力，改善運動狀態。
上文所提及的FSPR即功能性選擇性腰骶神經后根切斷術，由我國專家於1990年首先在亞洲地區運用於臨床治療上，在近二十年的發展改善後，已被業界同行公認為達到國際行進、國內領先的水平。FSPR術是通過對脊髓神經的處理，全面調整患者的肌肉張力，使痙攣肌肉的肌張力盡量接近正常狀態。
FSPR術具體的手術部位可以根據患者具體病情而定：在腰椎部進行手術可解決下肢痙攣，在頸椎部進行手術可解決上肢痙攣。在實施FSPR術的前後也應堅持長期正規的康復訓練，從而保證療效防止複發。如果腦癱患兒存在剪刀步、腳內翻等畸形情況，那麼在FSPR術后還應時行相應的矯形手術。
因為腦癱患兒的組織病變是非進行性的，表現在肢體上的癥狀是肌力不平衡引起的肢體畸形，破壞了肢體的力線而產生嚴重的肢體功能障礙，所以進行一次性多肢體多部位的矯形手術，主要是讓患者的肌力得到平衡，特別適合那些肢體已經發生攣縮和變形的患者，還有經過理療沒有明顯效果的患者。
腦癱二期矯形手術能將畸形矯正得較為徹底，矯正肢體的整體功能很快恢復，一般一周時間就能明顯見效。同時非手術部位的畸形也能因此而得到矯正。隨着各部分肌肉(如眼肌)逐漸用力正常，斜視等癥狀也就隨之消失，語言障礙也會進而好轉。需要記住的一點是，二期手術必須在解痙手術之後進行，否則這種矯形的效果無法保持。
需要強調的是，腦癱神經外科手術的效果與適應症的選擇有着密切的關聯：鑒於其治療機制，對於痙攣型腦癱或以痙攣為主的混合型腦癱治療效果突出;如果肌張力在3 級及以上者的患兒其痙攣程度重，影響日常生活和康復訓練，術后能夠使患者身體條件滿足康復需求才能為康復治療打下良好基礎;如果患兒的身體隨意運動功能良好，才能夠配合術后康復治療。
嚴重肌無力、不可逆性骨關節畸形患者、智商小於50%等情況的患兒，手術治療雖可糾正其強直狀態，但因為患兒不能很好地配合術后的康復訓練或是無法達到康複目標，因此也屬於不符合此類手術的患兒;同時肌張力低下型、共濟失調型腦癱患者也被排除在手術適應症之外，因為此種神經外科手術對這些患兒完全無效。
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